朕以宗人入继大统，获奉宗庙四十五年。深惟享国久长，累朝未有。乃兹弗起，夫复何恨！但念朕远奉列圣之家法，近承皇考之身教，一念惓惓，本惟敬天助民是务，只缘多病，过求长生，遂致奸人乘机诳惑，祷是日举，土木岁兴，郊庙之祀不亲，明讲之仪久废，既违成宪，亦负初心。迩者天启朕衷，方图改彻，而据婴仄疾，补过无由，每思惟增愧恨。
盖愆成昊端伏，后贤皇子裕至。仁孝天植，睿智夙成。宜上遵祖训，下顺群情，即皇帝位。勉修令德，勿遇毁伤。丧礼依旧制，以日易月，二十七日释服，祭用素馐，毋禁民间音乐嫁娶。宗室亲、郡王，藩屏为重，不可擅离封域。各处总督镇巡三司官地方攸系不可擅去职守，闻丧之日，各止于本处朝夕哭临，三日进香差官代行。卫所府州县并土官俱免进香。郊社等礼及朕祔葬祀享，各稽祖宗旧典，斟酌改正。
自即位至今，建言得罪诸臣，存者召用，殁者恤录，见监者即先释放复职。方士人等，查照情罪，各正刑章，斋蘸工作采买等项不经劳民之事悉皆停止。于戏！子以继志述事并善为孝，臣以将顺匡救两尽为忠。尚体至怀，用钦未命，诏告天下，咸使闻之。
在遗诏中，皇帝说我以宗室的身份继承大统，坐了四十五年天下，超越了所有祖宗，现在即使驾崩，也没有什么遗憾的。然后深刻检讨了自己，对登基以来的种种弊政进行忏悔、补救。朱厚熜，多么强势的一个人，真的会在遗诏中把自己否定了？当然不会！这篇遗诏根本就不是他写的，作者是两个人：徐阶、张居正。至于隆庆皇帝，他对这份遗诏是认可的。反正嘉靖年间，他一直居住在王府，一天政事也没管过，诏书中提到的坏事和他没有关系，否定弊政，可以为他赢得人心，还可以顺便发泄三十年来，压抑于心中的怒火。