根据德军在西欧作战屡屡得手的情况，朱可夫提出了一个立即组建装甲坦克兵团的计划。和征召预备役人员一样，斯大林在这个问题上犹豫不决，直到3月才同意组建他们所要求的20个机械化军——其实即使在2月就着手去办，也是为时已晚。因为当时苏联的工业生产能力有限，要装备这些机械化军需要3.2万辆坦克，其中新式坦克1.7万辆，这在一年之内是无法办到的。到苏德战争开始时，苏军的机械化军还不到计划数的一半。
在总参谋长的位置上了解全局之后，结合自己对战役战略问题的研究，朱可夫和他的主要助手们得出了这样的结论：苏联在防御方面存在着许多严重的缺点。某星期六的晚上，朱可夫带着一份汇报清单赶往斯大林的别墅，在场的有铁木辛哥、库利克和几位政治局委员。他将最紧要的东西简明地向斯大林做了陈述，强调必须采取紧急措施，克服西部边境防御中的严重缺陷。斯大林听后作出了指示，但朱可夫提出的措施却没有完全得到落实。
1941年3月到4月间，朱可夫领导总参谋部确定西部边境掩护计划和战时动员计划。5月底，朱可夫指示各边境军区司令员立即着手建立指挥所，后又于6月中旬下令各方面军指挥机关进入指挥所，要求他们在6月21日至22日到位。