《强学报》于1896年1月12日创刊，5日刊。担任该报主笔的是康有为避开张之洞而专门从广州调来的徐勤及何树龄。
徐勤、何树龄在政治信仰上自然听从康有为的指派，他们主编的《强学报》自然在政治倾向上接近康有为的激进政治主张。他们不顾清廷的规定，擅自公布清廷未经公开的“廷寄”，即光绪帝内发各省将军督抚议行十四条新政的上谕，此上谕已经遭到后党的反对和压制，明确不予实行，而《强学报》却把它公之于世，并附有短论称颂这份文件是清朝三百年来之“特诏”，是“中国自强之道基，臣民讲求时事之本”；甚至公然以为“破去拘牵之见，光大维新之命，化行风被，人人可以昌言新法”等等，以此鼓吹变法维新、救亡图强。凡此，显然都极易受到保守势力的攻击。
由于康有为在学术上反复论证孔子改制的理论，这对《强学报》的主编者有着很大的影响，因此在新创刊的《强学报》封面上，主编者徐勤等人有意将“孔子卒后二千三百七十三年”的所谓“孔子纪年”置于“光绪二十一年”之前，同时发表《孔子纪年说》，鼓吹使用“孔子纪年”以唤起人们的改革激情。然而康有为等人这一做法的客观效果却恰恰相反，“见者以为自改正朔，必有异志”，担心用孔子纪年取代清朝的纪年必将给强学会带来大祸，“会中一二俗士闻之，则舌挢汗下色变，惧祸将及己，汲汲请除名。曰是不奉今王之正朔也。”不奉今王的正朔，在当时帝制体制下可是杀头的罪名。于是发起人之一的梁鼎芬致函康有为，指责康不遵守发起人之间的约定，试图将《强学报》办成鼓吹自己的学术观点的私家刊物，“借局以行其经学”，已经违背了他们发起成立上海强学会、创办《强学报》的初衷，因此梁鼎芬表示“欲登报除名停办”。