政府软弱无力
米歇尔·米孔贝罗任布隆迪共和国总统以后，不但未能采取强有力的措施，来解决布隆迪经济落后的问题，反而使国家的经济进一步恶化。部族和解的问题也未得以解决，执掌军政大权的图西族与占全国人口85％的胡图族之间仍不断出现流血冲突。在1972年的两族冲突中，米孔贝罗调动军队严厉镇压胡图族，被屠杀的达数万人，首都布琼布拉胡图族的头面人物几乎均遭枪决，引起全国的震惊和不安。与此同时，米孔贝罗政府内部贪污腐化盛行，争权倾轧的斗争日趋严重。
这一状况引起了军队的不满，校官集团悄悄地策划政变，准备推翻米孔贝罗总统，接管政权。此时的米孔贝罗，本人虽身为军人、兼任国防部长，但他在武装部队中已无威望，
甚至处于众叛亲离的境地。
武装政变
1976年11月1日，武装部队第一副总参谋长让一巴蒂斯特·巴加扎中校和空军少校恩齐马纳发动政变，出动军队迅速控制了首都布琼布拉，接管了电台和政府机构，逮捕了米孔贝罗总统。武装部队的行动未遇到任何抵抗，成为一次不流血的军事政变。米孔贝罗总统被软禁。武装部队向全国广播的政变公报声称，他们所以接管政府权力，其主要原因是由于米孔贝罗总统已不能按照国家的利益行使权力，以及布隆迪的政治和经济状况严重恶化。