有研究者指出，高等教育管理学作为一门独立的应用型学科，具有鲜明的交叉性和融合性特点。这门学科经历了从不被承认、不被接受，到获得社会公认并且培养和造就了一批高等教育管理学硕士生、上万名高级管理干部，体现了学科自身的价值。学者对学科体系的研究体现了整体性、规律性、逻辑性和特色性。①
关于学科的研究对象，有研究者认为，高等教育管理学的研究对象从认识逻辑角度看，主要有三个方面：一是感性认识阶段的高等教育管理学对象；二是知性认识阶段的高等教育管理学对象；三是理性认识阶段的高等教育管理学对象。①有研究者认为，高等教育管理学有独特的研究对象——高等教育范围内的教育管理现象和规律。②
关于学科性质，有研究者认为，从认识论角度看，高等教育管理学是一门“软”性的、“应用”性较强的学科；从社会学角度看，高等教育管理学是一门“分散”度较高而“城市化”程度较低的学科。③有研究者认为，高等教育管理学应当是一门建立在多学科基础上的具有开放性和交叉性特征的学科。④